Tidak lama kemudian, seri ini sudah mengalami facelift di generasi keduanya. Spesifikasinya masih sama, hanya saja tulisan Alfa-nya berubah menjadi emboss, begitu pula dengan lampu seinnya yang kini berwarna silver.
3. Generasi Ketiga: Yamaha Alfa II R
Pada generasi ketiga inilah, seri Alfa mengalami perubahan yang signifikan. Warna blok mesin, tromol, tutup rantai, dan sayapnya berubah menjadi hitam. Di lain sisi, lampu seinnya masih dalam model gelap. Tulisan Yamaha ditemui di bagian behel belakang pipa dan jok. Striping-nya pun kini mendapat sentuhan atraktif.
4. Generasi Keempat: Yamaha Alfa II Z
Generasi keempat Alfa ini masih memiliki basic yang sama. Bedanya hanya terletak pada model knalpotnya yang runcing dan mendongak ke atas. Mengingat tidak jauh beda dengan yang lainnya, Yamaha Alfa II Z kurang familier pada waktu itu.
5. Yamaha Champ
Yamaha Champ terlahir dari DNA yang sama dengan seri Alfa. Bedanya, motor ini tampil dengan lebih sporty dengan setang model clip on. Motor ini juga sudah menggunakan garpu depan seperti motor sport, rem cakram, knalpot racing, dan tutup rantai separuh.